新德里，8月7日(IANS):加尔各答S. N. Bose国家基础科学中心的研究人员探索了一种管理低密度脂蛋白(LDL)或胆固醇水平升高等疾病的新方法。

蛋白质对我们的健康至关重要，发挥着广泛的功能。然而，不正确的蛋白质相互作用会导致疾病。传统上，科学家们一直试图开发小分子药物，作为蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)位点的竞争性抑制剂。然而，由于蛋白质相互作用区域的大而光滑的性质，这已被证明是困难的。

另一种方法是使用大肽或抗体来抑制PPIs，尽管这些方法可能昂贵且难以实施。

制药行业因此寻求更容易服用的小分子药物，通常是药丸形式。

一种很有前景的新方法涉及到变构抑制剂——一种与蛋白质的不同部分结合，改变其行为并防止有害相互作用的药物。

挑战在于确定蛋白质上的这些特殊目标点。研究人员提出了一种新的计算方案，使用先进的计算机模拟方法来预测和识别蛋白质表面上与功能位点变弹性耦合的替代结合口袋和热点。

作为一个测试案例，他们检测了PCSK9，一种通过与低密度脂蛋白受体(LDLR)相互作用来控制胆固醇水平的蛋白质。PCSK9-LDLR相互作用增加可升高LDL水平，导致心脏病。目前针对PCSK9的治疗价格昂贵，并不适合所有人。找到一种口服小分子药物可以阻断PCSK9-LDLR相互作用，这可能是革命性的。

Suman Chakrabarty博士的团队在识别PCSK9蛋白的可靶向部分方面取得了重大进展。他们用热力学论证了变构的双向性质可以识别变构袋。通过比较结合和非结合蛋白状态的构象集合，他们提出针对非结合状态的独特构象进行药物发现。学术界和工业界之间的这种合作方式不仅旨在降低胆固醇，而且还旨在创造一种新的药物设计范例，更有效地针对蛋白质来预防疾病。